Keby boli atómy skutoče elektricky neutrálne preniknuteľné lopty, potom by alfa častice museli cez zlatú fóliu jednoducho preletieť a naraziť na obrazovku. Na veľké prekvapenie každého však boli niektoré alfa častice odklonené od pôvodného smeru letu pod veľkým uhlom. Niektoré boli dokonca odrazené prakticky späť! Očividne sa muselo hľadať nejaké vysvetlenie.